行政审批制度改革虽然取得了明显成效，但也要清醒地认识到，行政审批领域还存在不少突出问题。主要表现在：一是重审批轻监管的现象依然存在，审批项目仍然较多。一些审批项目被合并或调整为审核、事前备案等，虽然改变了形式，但没有改变审批的实质。一些审批事项程序繁琐、时限长、办事效率低下。二是对行政审批设定管理不严。特别是对非行政许可审批项目，管理不规范，随意性大。一些部门和地区利用“红头文件”、规章等，以登记、备案、年检、监制、认定、审定以及准销证、准运证等形式，变相设置审批事项。三是对行政权力的监督机制还不健全。一些部门权力过于集中，同时承担审批、执行、监督、评价职能，权力被滥用的风险较大。深化行政审批制度改革，要在总结经验的基础上，增强针对性，着力解决这些突出问题。
行政审批制度改革是一项长期而艰巨的任务，必须坚定不移地继续向前推进。针对存在的问题。
一是积极推动国务院决定的贯彻落实。会同有关部门，对国务院决定执行情况开展监督检查。督促各地各部门制定后续监管措施，搞好工作衔接，确保落实到位。对有令不行、有禁不止，不认真落实决定，以及违反决定继续实施审批或者变相审批等问题，督促整改并通报批评;对情节严重的，追究有关人员的责任。
二是按照应减必减、该放就放的原则，适时组织对国务院部门的行政审批项目开展新一轮清理，提出取消和调整建议。探索建立审批项目动态清理工作机制。
三是积极推进行政审批规范化建设。编制并公布国务院部门保留的行政审批项目目录。严格审核国务院部门拟新设的审批项目，建立健全新设审批项目审核论证机制。逐步规范非行政许可审批项目的设定和管理。督促有关部门切实履行监管职责，加强日常动态监管。
四是进一步健全行政审批服务体系。继续推进政务中心建设，健全省、市、县、乡四级联动的政务服务体系，并逐步向村、社区延伸。推动审批项目较多的国务院部门建立政务大厅或服务窗口。加强行政审批绩效管理，推行网上审批、并联审批、服务质量公开承诺等做法，不断提高行政审批服务水平。
五是深入推进行政审批领域防治腐败工作。深入排查审批权力运行中的廉政风险点，健全廉政风险防控机制。进一步深化审批公开，推行“阳光审批”。加快推广行政审批电子监察系统。严肃查处利用审批权违纪违法的案件。
